This repository contains the documents and files submitted in accompaniment with my Senior Honours Project which serves as partial credit towards the final year of my undergraduate degree in Computational Physics (BSc) at The University of Edinburgh.
. ├── Datasets │ ├── England_Variants.csv │ ├── Reduced_England_Variants.csv │ ├── covid19_infection_survey_scotland.xlsx │ ├── covid_infection_survey_headline.xlsx │ ├── data_2023-Dec-14.csv │ └── positivityovertime.xlsx ├── Documents │ ├── Images │ │ ├── All_Spatial_Infection_Plots_2000.png │ │ ├── CombinedPlot.png │ │ ├── Contour_Plot_01.png │ │ ├── Contour_Plot_05.png │ │ ├── Enhanced_R0_3.png │ │ ├── Expanded SIR Model.png │ │ ├── GammaPDF.png │ │ ├── ONS_Oscils.png │ │ ├── PandA_Crest.jpeg │ │ ├── Reduced_CombinedPlot.png │ │ ├── SEIRSoscils.png │ │ ├── SEIRSoscilsfull.png │ │ ├── SEIR_218_091_182.png │ │ ├── SIRS_218_071_01.png │ │ ├── SIR_218_071.png │ │ ├── SIR_SEIR.png │ │ ├── Spatial_Infection_Plot_024_2000.png │ │ ├── Spatial_Infection_Plot_03_2000.png │ │ ├── Spatial_Infection_Plot_04_2000.png │ │ ├── Spatial_Infection_Plot_05_2000.png │ │ ├── Spatial_Infection_Plot_08_2000.png │ │ ├── VariancePlotNew.png │ │ ├── WHO_Focused_Oscils.png │ │ ├── WHO_Very_Focused_Oscils.png │ │ ├── Wave.gif │ │ ├── WaveCycle.jpg │ │ ├── WaveCycleExtended.png │ │ ├── Wave_024.gif │ │ ├── Wave_03.gif │ │ ├── Wave_04.gif │ │ ├── Wave_05.gif │ │ └── Wave_08.gif │ ├── Poster │ │ └── ProjectPosterFINAL.pdf │ ├── SH_Project_Report_Final.pdf │ └── Timeline_Notes.pdf ├── Models │ ├── Data_Files │ │ ├── Infected_Data.txt │ │ ├── Infected_Data_2.txt │ │ ├── Variance_Data_1.txt │ │ ├── Wave_Data.txt │ │ ├── Wave_Data_024.txt │ │ ├── Wave_Data_03.txt │ │ ├── Wave_Data_04.txt │ │ ├── Wave_Data_05.txt │ │ └── Wave_Data_08.txt │ ├── Plot.py │ ├── PlotSpatialSIRS.py │ ├── SpatialSIRS.py │ ├── Trial_Models │ │ ├── GammaTest.py │ │ ├── SEIR.py │ │ ├── SEIRS.py │ │ ├── SIR.py │ │ ├── SIRS.py │ │ ├── SIRadvanced.py │ │ └── gammaSIRS.py │ └── pycache │ ├── Compartment.cpython-38.pyc │ ├── CriticalCare.cpython-38.pyc │ ├── Deceased.cpython-38.pyc │ ├── Hospitalised.cpython-38.pyc │ ├── Infected.cpython-38.pyc │ ├── PostCritical.cpython-38.pyc │ ├── Resistant.cpython-38.pyc │ └── Susceptible.cpython-38.pyc └── README.md
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